防治细菌病害的主要药剂有：四霉素、噻菌铜、叶枯唑、荧光假单胞杆菌、中生菌素、乙蒜素、春雷霉素、申嗪霉素、氢氧化铜、王铜等。
四霉素：用于防治植物病害、虫害及杂草,或用于防治木材、纸张、皮革、纤维、复合材料中的真菌、细菌、虫害。四霉素是一种高效广谱杀菌剂。
噻菌铜：称“龙克菌”,它是一种高效、低毒、安全的噻唑类有机铜杀菌剂,其特点为结构新颖、剂型先进、内吸传导性能较好。
叶枯唑：内吸杀菌剂,高效低毒。叶枯唑对由细菌引起的死苗、烂根、软腐、溃疡、青枯、角斑、穿孔等效果明显。
荧光假单胞杆菌：一种重要的植物病害生防菌和根际促生菌（PGPR），具有繁殖速度快、适应能力强、易于人工培养、制剂稳定、施用方便、不污染环境、防治多种植物病害等优点。
中生菌素：可以通过抑制细菌的菌体蛋白质合成和使真菌菌丝畸形,从而抑制孢子萌发和杀死孢子而致有害菌、病菌失效,如革兰氏阳性和阴性菌、分枝杆菌、酵母及真菌。
乙蒜素：一款使用多年的老产品，早已全球化了，但它是中国开发的一种植物仿生农药，系大蒜提取物，当初主要用于种子处理，后广泛应用于多种作物防治真菌、细菌性病害，是无公害农产品生产的首选药剂。
春雷霉素：一种由链霉菌产生的弱碱性抗菌素,是一种农用抗生素杀菌剂。具有较强的内吸传导性,渗透性强并能在植物体内移形,喷洒后见效快,抗雨水侵蚀,持续时间长。
申嗪霉素：是“水稻三病”等病害、瓜果蔬菜枯萎病、蔓枯病、根腐病、疫病等土传病害等难以的顽症“克星”,同时在土壤处理方面也有独特功能。
氢氧化铜：一种广谱杀菌剂,通过释放铜离子均匀覆盖在植物表面,防止真菌孢子侵入而起保护作用,当病菌的细胞接触铜离子之后,将其杀死,而对植物没有影响,所以是一种无残留、无公害的农药。
王铜：由春雷霉素和王铜(氧氯化铜)混配的一种复合型低毒杀菌剂,具有保护和治疗双重杀菌作用。混剂渗透性好、粘着性强,耐雨水冲刷,持效期较长。