当纸质文物感染霉菌时，霉菌就会以纸、淀粉糨糊、胶料以及油墨等作为营养物质并排出废物，同时造成图书资料的封面、扉页、书页散落。更为重要的是霉菌在新陈代谢过程中，能产生许多物质，对纸质文物造成危害。
①霉菌分泌的纤维素酶，可以加速纸张纤维素的水解。在纤维素酶的催化下，纤维素水解成纤维二糖，再进一步水解最后生成葡萄糖，葡萄糖是能溶于水的小分子物质，是霉菌能直接吸收利用的最好碳源和能源。纤维素酶能在3个月内把纸张纤维素毁去10％～60％，纸张的牢固性在5d内会降低50％。
②霉菌分泌的有机酸，亦可加速纸张纤维素的水解。霉菌新陈代谢过程中能分泌有机酸，如没食子曲霉分泌出没食子酸等。在霉菌菌丝蔓延的地方，纸张的酸度在几个月内能增加两倍。酸是纸张纤维素水解的催化剂。当图书资料受潮后，纸张中含水量增加，大量霉菌繁殖，从而分泌出的有机酸增多，有机酸使纸张纤维素水解生成水解纤维素，再进一步水解生成葡萄糖。
③霉菌能分泌色素，以致在绘画、书籍上出现各种颜色的斑点（红、*、灰、紫、棕、黑、褐等色）。这些斑点色素性能稳定，大多不溶于水，很难从书页上除掉，不仅污染绘画、书籍，掩盖图案、字迹，而且使纸张变脆、腐烂。
④霉菌产生有*次级代谢物，危害人体健康。比如交链孢霉产生致癌和致突变*素AOH和AME；桔青霉产生的具有神经*性的桔青霉*素，亦是一种肾脏*素；其中*性和致癌性最强的为*曲霉素B1（AFB1），其*性比眼镜蛇的*汁还*，约为氰化钾的10倍。
霉菌细胞中缺乏叶绿素，本身不能制造糖类，需要从外界环境中不断吸收营养物质，从中获得进行生命活动所需要的能量，并合成新的细胞物质。其营养物质主要包括碳源（糖类、淀粉、纤维素等）、氮源（尿素、硝酸盐、氨基酸等）、必要的微量元素。